Cu aceeași aeronavă încearcă și zboruri de noapte. Relațiile bune cu aliații germani îi facilitează un zbor de probă cu trimotorul Dornier Do.24. Zboară și Junkers W 34 absolvind încă o școală de zbor fără vizibilitate la Constanța.

La 1 noiembrie 1943 este numit la comanda Flotilei de Hidroaviație și a Comandamentului Aero Marină. Misiunile de escortă anti-submarin cu Heinkel 114 protejează retragerea din Crimeea, așa-numita operațiune "60 000". Cant-ul Z 501 este sporadic folosit în recunoașteri.

Bombardamentele sovietice asupra portului Constanța au fost ineficiente tot războiul. Însă pe 20 August 1944, în ziua ofensivei terestre sovietice, bombardamentul în picaj cu Petlyakov Pe-2 face ravagii. Sfârșitul este aproape, pe 22 august este ocupat Iașul iar în seara lui 23 August are loc lovitura de stat. Pe 23 august Gheorghe Borcescu zboară pentru ultima oară, carnetul de zbor menționează o neconfirmată deplasare de hidroavioane la Călărași. Pe 24 august, amiralul Horia Macellariu și comandantul german al Mării Negre, viceamiralul Helmuth Brinkmann discută intens. În virtutea camaraderiei de arme dintre foștii aliați și în ciuda ordinelor de la Berlin, germanii se retrag fără schimburi de focuri. Pentru salvarea Constanței, Horia Macellariu va fi răsplătit cu ani grei de lagăr. Pe 25 părăsesc Sutghiolul cu direcția Varna ultimele DO24 și BV 138 ale Seenotbereichskommando 12. Pe 27 august amerizează hidroavionul sovietic MBR 2 având la bord pe comisarul marinei, amiralul Nikolai Gherasimovich Kuznetsov. În ciuda relațiilor cordiale între Kuznetsov și Gh. Borcescu, ocupantul dezarmează personalul român, fură din zestrea unității și preia baza. Flotila de Hidroaviație este nevoită să părăsească lacul Sutghiol, urmând a fi conservată în secret pe lacul Snagov. Gheorghe Borcescu predă comanda flotilei pe 20 noiembrie.

Pentru 2 luni este numit comandantul Școlii de Ofițeri de Aviație. Cu aportul rușilor rămâne fără unele bunuri personale, iar în decembrie 1945 este trecut în rezervă. Lucrează o vreme la uzinele Wolff. Regimul comunist nu îl trimite în lagăre de concentrare. Constrângerile ce vor urma sunt o inițială consemnare la domiciliu cu supravegherea Securității, mica pensie și stigmatul de "origine nesănătoasă" aplicat copiilor. Un posibil indiciu cu privire la blândețea autorităților ar putea fi rolul jucat de fratele cel mai mare, Gen. Stat Major Enache Borcescu. Cu oblăduirea Serviciului de Siguranță al Statului, acesta făcea parte dintr-un grup conspirativ împotriva luptei peste Nistru, a lui Ion Antonescu și pentru recuperarea Ardealului de Nord. În "Communist Terror in Romania", Dennis Deletant, pag. 43, se afirmă că Enache Borcescu ar fi divulgat informații operative celebrului "inginer Ceaușu, Emil Bodnarenko - Bodnaras. Indiferent de circumstanțele ce l-au salvat de la represiuni, cariera Cpt. Cdor Borcescu sub 3 regi ai României este fără pată: peste 2500 de ore de zbor cu 12 800 aterizări pe 47 tipuri de aeronavă. A fost apreciat de colegi pentru caracterul său modest și vesel iar cei 76 elevi brevetați au remarcat calitățile sale pedagogice.

Pensionat, păstrează nostalgia aviației și își dedică timpul pasiunilor sale: matematica și istoria. La bătrânețe are un gând: să cuprindă istoria omenirii într-un mare atlas pe care îl numește Istoria Universală Schematizată Sistematic. Timp de 8 ani, pe hârtie milimetrică A0, așează laolaltă cronologia tuturor formațiunilor politice cunoscute pe Terra. Lasă nepoților mai multe ediții "spre a fi păstrate și completate".

"La 27 aprilie 1983 Gh. Borcescu s-a îmbarcat pe ultima navă a vieții sale, să o numim Canoniera Lt. Lepri, care este escortată de un hidroavion și au luat largul; nava care-l duce a coborât sub orizontul curb al mării, a rămas în vedere doar catargul cu verga semnalelor de care flutură pavilioanele unui semnal și hidroavionul. Gh. Borcescu ne semnalează "Bun cart înainte". A dispărut și catargul cu semnalul, a dispărut și hidroavionul de escortă. Nu se mai vede nimic iar C-dor-ul Av. Gh. Borcescu sboară în văzduhul Cunoașterii, spre a afla Adevărul!", spune despre Gh. Borcescu c-amiralul (r) Horia Macellariu.